Stručne o projekte

Výskum choroby/vírusu malárie, testovanie nových liečiv a zároveň predpovedanie jej šírenia

Moderátor: Moderátori

Užívateľov profilový obrázok
slavko.sk
Príspevky: 1603
Dátum registrácie: Po Feb 05, 2007 4:42 pm
Bydlisko: Bratislava, Slovensko
Kontaktovať užívateľa:

Stručne o projekte

Príspevokod užívateľa slavko.sk » Ut Feb 06, 2007 1:41 am

malariacontrol.net

Pre pridanie projektu do BOINC Managera je potrebné použiť túto linku: http://www.malariacontrol.net/
Náš tím BOINC.SK, kde sa dá cez voľbu "Join" pridať.

Projekt a jeho aplikácia využíva výpočtový výkon na náhodné modelovanie klinickej epidemiológie a prirodzeného vývoja parazita Plasmodium falciparum malaria ktorý spôsobuje známu chorobu malária.

Projekt je pomerne stabilný a malou nevýhodou je že čas na spočítanie výsledku je len 3 dni a tým pádom je vhodný pre počítače ktoré sú k internetu pripojené nonstop. Orientačne jeden WU trvá cca 2 hodiny na amd64 3200+, 5-6 hodín na PIII 600MHz.
Naposledy upravil/-a slavko.sk v So Feb 10, 2007 11:43 pm, upravené celkom 1 krát.

Honza
Príspevky: 953
Dátum registrácie: Po Feb 05, 2007 8:20 pm
Bydlisko: Praha

Príspevokod užívateľa Honza » So Feb 10, 2007 6:09 pm

A second science application for malariacontrol.net

We are preparing the second science application to be run using malariacontrol.net. We plan to upload this application next Tuesday (Feb 13th) if our last tests come out ok.
This application was developed at the Swiss Tropical Institute and predicts the spatial distribution of malaria. We'll post a short description of the scientific objectives in this thread early next week. As with all malariacontrol.net applications, the results will be published in peer reviewed literature.

There are a few things that are worth pointing out: This application makes use of BOINC's wrapper approach for legacy applications. This has a few drawbacks: there is no checkpointing and no feedback from the application about progress. Therefore a workunit will start from the beginning if interrupted. This should not be a big problem because the workunits are relatively short (less than half an hour on most PCs).

We have several batches of workunits that we plan to send out over the next few weeks. This first stage will comprise a total of 200'000 workunits. The current simulation model will keep running and send out work in parallel.

Užívateľov profilový obrázok
slavko.sk
Príspevky: 1603
Dátum registrácie: Po Feb 05, 2007 4:42 pm
Bydlisko: Bratislava, Slovensko
Kontaktovať užívateľa:

Príspevokod užívateľa slavko.sk » So Feb 10, 2007 6:31 pm

Inymi slovami: pripravuje sa druha vedecka aplikacia pre tento projeky. Na server bude umiestnena v utorok 13. februara kedy by sa mala postupne distribuovat aj na vase pocitace.
Aplikacia predpoveda priestorove sirenie parazita a zaciatkom tyzdna bude o nej k dizpozicii viac informacii.
Podstatna vec: aplikacia neuklada stav vypoctu takze stale sa bude WU aj po preruseni ratat odznovu. Sice jeden WU bude trvat pod 1/2 hodinu na modenrych masinach ale predsa len by bolo lepsie ak by bol pocitac zapnuty nonstop a bezal na nom len tento projekt.
Sucastna aplikacia bude existovat paralelne s touto novu a na novu bude k dispozicii na zaciatok cca 200.000 WU na stiahnutie.
Naposledy upravil/-a slavko.sk v So Feb 10, 2007 11:44 pm, upravené celkom 1 krát.

Užívateľov profilový obrázok
gabberattack
Príspevky: 1275
Dátum registrácie: Ut Feb 06, 2007 2:35 am
Bydlisko: Mooresville, NC
Kontaktovať užívateľa:

Príspevokod užívateľa gabberattack » So Feb 10, 2007 11:08 pm

slavko.sk napísal:Aplikacia predpoveda priestorova sirenie virusu a zaciatkom tyzdna bude o nej k dizpozicii viac informacii.


Ja len ze Malaria je sposobena parazitom. Pripravim clanok o tejto chorobe len co budem mat chvilku volna v skole.
-gabberattack-
Keep The Panic!

...a Windows Vista
padá na Mesiaci
6x pomalšie!

Užívateľov profilový obrázok
slavko.sk
Príspevky: 1603
Dátum registrácie: Po Feb 05, 2007 4:42 pm
Bydlisko: Bratislava, Slovensko
Kontaktovať užívateľa:

Príspevokod užívateľa slavko.sk » So Feb 10, 2007 11:44 pm

gabberattack napísal:
slavko.sk napísal:Aplikacia predpoveda priestorova sirenie virusu a zaciatkom tyzdna bude o nej k dizpozicii viac informacii.


Ja len ze Malaria je sposobena parazitom. Pripravim clanok o tejto chorobe len co budem mat chvilku volna v skole.


Dik za upozornenie, neviem odkial som vzal ten virus. Jasne ze je to parazit.

Honza
Príspevky: 953
Dátum registrácie: Po Feb 05, 2007 8:20 pm
Bydlisko: Praha

Príspevokod užívateľa Honza » Ne Feb 11, 2007 10:06 am

gabberattack napísal:Ja len ze Malaria je sposobena parazitom. Pripravim clanok o tejto chorobe len co budem mat chvilku volna v skole.
To je dobry napad.
Navic muze byt o dva rady lepsi nez to, co vypustil forest za hruzu a srajdu.
(clanecek o SIMAPu, co mi posilal ke korekturam, uz je mnohem lepsi a vlastne velmi dobry).

Užívateľov profilový obrázok
MeX
Site Admin
Príspevky: 479
Dátum registrácie: Po Feb 05, 2007 3:13 pm
Bydlisko: Bratislava, Slovensko
Kontaktovať užívateľa:

Príspevokod užívateľa MeX » Po Dec 10, 2007 6:49 pm

gabberattack napísal:
slavko.sk napísal:Aplikacia predpoveda priestorova sirenie virusu a zaciatkom tyzdna bude o nej k dizpozicii viac informacii.


Ja len ze Malaria je sposobena parazitom. Pripravim clanok o tejto chorobe len co budem mat chvilku volna v skole.

Este je to aktualne? Nemuselo by to byt nejake moc dlhe, len zakladne fakty..

Užívateľov profilový obrázok
gabberattack
Príspevky: 1275
Dátum registrácie: Ut Feb 06, 2007 2:35 am
Bydlisko: Mooresville, NC
Kontaktovať užívateľa:

Príspevokod užívateľa gabberattack » Po Dec 10, 2007 10:35 pm

MeX napísal:
gabberattack napísal:
slavko.sk napísal:Aplikacia predpoveda priestorova sirenie virusu a zaciatkom tyzdna bude o nej k dizpozicii viac informacii.


Ja len ze Malaria je sposobena parazitom. Pripravim clanok o tejto chorobe len co budem mat chvilku volna v skole.

Este je to aktualne? Nemuselo by to byt nejake moc dlhe, len zakladne fakty..


Je to aktualne, len ako som pisal, som prave dost zaneprazdneny v skole. Prave mi zacala dvojtyzdnovka skusok. Mam tak akurat par minut na precitanie fora. Aktualne veci na ktorych robim: clanok o malarii, navod na instalaciu BOINC na roznych systemoch (windows, linux, mac, solaris) v spolupraci s Kiwi-m, navod na personalizovanie nastaveni BOINCu a nakoniec preklad webu Rosetta@home do slovenciny - ten je uz takmer hotovy, ale robil som to na windows masine v programe, ktory bezi len pod windows. Mam mensi problem teraz, lebo poslednej windows masiny som sa zbavil asi pred mesiacom, takze poskladam si nejaky stary srot len na to a dokoncim to vsetko pocas Vianocnej pauzy.

edit: chcel by som opat poprosit niekoho, kto ma cas a rozumie BAM! systemu, nech skusi nieco napisat, bolo by to dobre dat do sekcie nastaveni BOINCa. Ja so sa k tomu vobec nedostal, hoci som si ucet zalozil, necital som podrobne navod.
-gabberattack-
Keep The Panic!

...a Windows Vista
padá na Mesiaci
6x pomalšie!

dango
Príspevky: 80
Dátum registrácie: Ut Jan 27, 2009 11:57 pm
Bydlisko: Poprad / Kosice

Re: Stručne o projekte

Príspevokod užívateľa dango » Ut Mar 02, 2010 11:35 am

dalsia faza je za nami.... posielanie bolo pozastavene na "par" tyzdnov... Uvidime, ako budu dlhe :)


Návrat na "malariacontrol.net"

Kto je prítomný

Užívatelia prezerajúci toto fórum: Žiadny pripojení užívatelia a 1 neregistrovaný