World Community Grid zakladne info
Napísané: Ut Máj 08, 2007 4:34 pm
The United Devices Smallpox Research Grid Project bol sponzorovany IBM, aby sa
urychlilo liecenie virusu kiahni (smallpox). The Smallpox studia pouzila pocitacovu
chemiu v masivnom grid projekte na analyzu kandidatov na medicinske testovanie
proti virusu kiahni. Projekt pomohol zobrazit 35x10^6 moznych molekul lieciv
na niekolko proteinov virusu kiahni a zistit vhodnych kandidatov na liecbu.
Po 72 hodinach bolo vratenych 100 000 vysledkoch, do skoncenia projektu sa
objavilo 44 silnych kandidatov na dalsi vyskum. Po tomto uspechu IBM 16.11.2004
oznamilo vytvorenie World Community Grid (WCG), a vytvorilo prostredie, v ktorom mohli
bezat dalsie vedecke projekty. WCG najprv podporovalo len Windows pouzivajuc proprietarnu
technologiu z United Devices, ktora podporovala grid.org. Poziadavka na podporu Linuxu
viedla k open source BOINC grid technologii na ktorej bezi Seti@home and CPDN.
Bola zahrnuta aj podpora Mac OS. K 24.3.2007 mal WCG cca. 272 000 clenov a 550 000
pracovnych stanic. Strojovy cas je ekvivalentny 82 000 rokom a bolo ziskanych
80x10^6 vysledkov. WCG aktualizuje statistiku viac krat za den. Co je WCG ?
Je to projekt, z ktoreho profituju vsetci ludia, sponzorovany IBM. WCG spaja mnoho
pocitacov, vytvarajuc obrovsky system s velkym vypoctovym vykonom, ktory vysoko
prevysuje silu superpocitacov. Pretoze je praca rozdelovana na male kusky, ktore
je mozne pocitac sucasne, cas vypoctu je redukovany z rokov na mesiace.
Tato technologia je tiez velmi lacna, umoznujuc lepsie vyuzit drahe zdroje.
Completed Projects:
Human Proteome Folding Phase.
Prvym projektom bol
Human Proteome Folding Project 1 (HPF1), ktoreho cielom je predikovat strukturu
ludskych proteinov. Bol navrhnuty Richardom Bonneauom z Institute for Systems Biology,
na vypocet podobnych struktur pre kazdy protein a pouziva Rosetta skore.
Z tychto prognoz je mozne predpokladat funkciu nekonecneho mnozstva proteinov.
Tento narast poznatkov o ludskych proteinoch je velmi dolezity na hladanie
liecebnych metod ludskych nemoci. Tento projekt bol uzavrety 18.7.2006.
Aktivne projekty:
FightAIDS@Home bol spusteny 15.11.2005, ako prvy projekt,
ktory bol cieleny iba na jedno ochorenie. Kazde PC pocita jednu moznu molekulu
lieku a zistuje ako sa naviaze na HIV proteazu, pracujuc ako jej inhibitor.
FightAIDS@Home pouzival do maja 2003, Entropia platformu.
Human Proteome Folding Phase 2 (HPF2) bol ako treti projekt spusteny
23.6.2006. Tento projekt nasledujuc HPF1, je zamerany na sekrecne proteiny,
zo specialnym zameranim na biomarkery a proteiny na povrchu buniek, ako
aj na plasmodium, povodcu malarie. HPF2 pouziva modely proteinov s vyssim
rozlisenim, ktore maju lepsiu vyuzitelnost, ale tiez potrebuju vykonnejsie PC.
To bol vylucne prvy projekt WCG, ktory nebol zdielany s inymi grid projektmi.
WCG bude v buducnosti spustat exkluzivne svoje projekty.
Help Defeat Cancer bol spusteny 20.7.2006. Bol zamerany na zlepsenie liecby
rakoviny prsnika, mozgu a krku. Velke mnozstvo tkaniv bolo preskumanych
technologiou, ktora skuma vzorky tkaniva priemeru 0.6 mm, ulozenych
po odbere do parafinu, v poli max. 32x32 vzoriek. Tie su potom skenovane.
Genome Comparison bol spusteny 21.11.2006, z Fiocruz v Rio de Janeiro.
Porovnava genove sekvencie medzi roznymi organizmami, za ucelom najdenia
podobnych genov. Cielom je objavenie toho, naco sluzi prislusna sekvencia
a aku funkciu plni v jednom organizme a jej porovnanie so znamou funkciou
v inom.
Help Cure Muscular Dystrophy je najnovsim projektom a bol uvolneny
19.12.2006 Decryphton, ( spolupraca French Muscular Dystrophy Association,
French National Center for Scientific Research a IBM ). Projekt zistuje
vzajomne reakcie proteinov, medzi 40 000 proteinmi, ktorych strukturu
pozname, so zameranim na tie, ktore hraju rolu v nervovo-svalovych ochoreniach.
Produkovana databaza pomoze vedcom vyvinut molekuly, na inhibiciu alebo
zvacsenu vazobnu schopnost niektorych makromolekul, veducich k lepsej
liecbe svalovej dystrofie a inych nervovo-svalovych ochoreni.
To je asi vsetko, spustite na necinnych pocitacoch, ktore spotrebuvaju
120 W vykonu na 0.1 promile cinnosti procesora, nieco uzitocne, vykon
sa zvacsi asi o 15 az 65 W, ale prinesie to uzitok chorym a vam radost,
ze ste niekomu pomohli, vyrazne zlepsit kvalitu zivota.
urychlilo liecenie virusu kiahni (smallpox). The Smallpox studia pouzila pocitacovu
chemiu v masivnom grid projekte na analyzu kandidatov na medicinske testovanie
proti virusu kiahni. Projekt pomohol zobrazit 35x10^6 moznych molekul lieciv
na niekolko proteinov virusu kiahni a zistit vhodnych kandidatov na liecbu.
Po 72 hodinach bolo vratenych 100 000 vysledkoch, do skoncenia projektu sa
objavilo 44 silnych kandidatov na dalsi vyskum. Po tomto uspechu IBM 16.11.2004
oznamilo vytvorenie World Community Grid (WCG), a vytvorilo prostredie, v ktorom mohli
bezat dalsie vedecke projekty. WCG najprv podporovalo len Windows pouzivajuc proprietarnu
technologiu z United Devices, ktora podporovala grid.org. Poziadavka na podporu Linuxu
viedla k open source BOINC grid technologii na ktorej bezi Seti@home and CPDN.
Bola zahrnuta aj podpora Mac OS. K 24.3.2007 mal WCG cca. 272 000 clenov a 550 000
pracovnych stanic. Strojovy cas je ekvivalentny 82 000 rokom a bolo ziskanych
80x10^6 vysledkov. WCG aktualizuje statistiku viac krat za den. Co je WCG ?
Je to projekt, z ktoreho profituju vsetci ludia, sponzorovany IBM. WCG spaja mnoho
pocitacov, vytvarajuc obrovsky system s velkym vypoctovym vykonom, ktory vysoko
prevysuje silu superpocitacov. Pretoze je praca rozdelovana na male kusky, ktore
je mozne pocitac sucasne, cas vypoctu je redukovany z rokov na mesiace.
Tato technologia je tiez velmi lacna, umoznujuc lepsie vyuzit drahe zdroje.
Completed Projects:
Human Proteome Folding Phase.
Prvym projektom bol
Human Proteome Folding Project 1 (HPF1), ktoreho cielom je predikovat strukturu
ludskych proteinov. Bol navrhnuty Richardom Bonneauom z Institute for Systems Biology,
na vypocet podobnych struktur pre kazdy protein a pouziva Rosetta skore.
Z tychto prognoz je mozne predpokladat funkciu nekonecneho mnozstva proteinov.
Tento narast poznatkov o ludskych proteinoch je velmi dolezity na hladanie
liecebnych metod ludskych nemoci. Tento projekt bol uzavrety 18.7.2006.
Aktivne projekty:
FightAIDS@Home bol spusteny 15.11.2005, ako prvy projekt,
ktory bol cieleny iba na jedno ochorenie. Kazde PC pocita jednu moznu molekulu
lieku a zistuje ako sa naviaze na HIV proteazu, pracujuc ako jej inhibitor.
FightAIDS@Home pouzival do maja 2003, Entropia platformu.
Human Proteome Folding Phase 2 (HPF2) bol ako treti projekt spusteny
23.6.2006. Tento projekt nasledujuc HPF1, je zamerany na sekrecne proteiny,
zo specialnym zameranim na biomarkery a proteiny na povrchu buniek, ako
aj na plasmodium, povodcu malarie. HPF2 pouziva modely proteinov s vyssim
rozlisenim, ktore maju lepsiu vyuzitelnost, ale tiez potrebuju vykonnejsie PC.
To bol vylucne prvy projekt WCG, ktory nebol zdielany s inymi grid projektmi.
WCG bude v buducnosti spustat exkluzivne svoje projekty.
Help Defeat Cancer bol spusteny 20.7.2006. Bol zamerany na zlepsenie liecby
rakoviny prsnika, mozgu a krku. Velke mnozstvo tkaniv bolo preskumanych
technologiou, ktora skuma vzorky tkaniva priemeru 0.6 mm, ulozenych
po odbere do parafinu, v poli max. 32x32 vzoriek. Tie su potom skenovane.
Genome Comparison bol spusteny 21.11.2006, z Fiocruz v Rio de Janeiro.
Porovnava genove sekvencie medzi roznymi organizmami, za ucelom najdenia
podobnych genov. Cielom je objavenie toho, naco sluzi prislusna sekvencia
a aku funkciu plni v jednom organizme a jej porovnanie so znamou funkciou
v inom.
Help Cure Muscular Dystrophy je najnovsim projektom a bol uvolneny
19.12.2006 Decryphton, ( spolupraca French Muscular Dystrophy Association,
French National Center for Scientific Research a IBM ). Projekt zistuje
vzajomne reakcie proteinov, medzi 40 000 proteinmi, ktorych strukturu
pozname, so zameranim na tie, ktore hraju rolu v nervovo-svalovych ochoreniach.
Produkovana databaza pomoze vedcom vyvinut molekuly, na inhibiciu alebo
zvacsenu vazobnu schopnost niektorych makromolekul, veducich k lepsej
liecbe svalovej dystrofie a inych nervovo-svalovych ochoreni.
To je asi vsetko, spustite na necinnych pocitacoch, ktore spotrebuvaju
120 W vykonu na 0.1 promile cinnosti procesora, nieco uzitocne, vykon
sa zvacsi asi o 15 az 65 W, ale prinesie to uzitok chorym a vam radost,
ze ste niekomu pomohli, vyrazne zlepsit kvalitu zivota.