Strana 1 z 3

Aktualne aplikacie

Napísané: St Nov 21, 2007 5:48 am
od užívateľa Hefto99
Rosetta ma novu aplikaciu 5.85

novinky zahrnaju (volny preklad):
- diagnostiku pre rozdielny typ symetrie ('D2')
- opravu pre modelovanie velkych symetrickych komplexov + mensie naroky na pamat
- novy format vystupu ktory moze byt uzitocny pre navrh novych proteinov
- zopar vacsich vylepseni pre predpovedanie struktury RNA

v originaly tu Rosetta Application Version Release Log

[edit] Pripadne problemy s novou aplikaciou mozete reportovat tu. [/edit]

Napísané: Št Nov 29, 2007 5:34 am
od užívateľa Hefto99
Bola vydana nova aplikacia pre Linux.

Jedna sa iba o synchronizaciu kodu s aplikaciami pre Windows a Mac. Linux ma teraz verziu 5.86 a ta je kodovo totozna s Win a mac verziami 5.85

Napísané: Št Dec 06, 2007 11:57 pm
od užívateľa marpes
Je na tom nieco pravdy, ze posledne aplikacie vyzaduju 800 MB RAM/WU?

Napísané: Pi Dec 07, 2007 5:54 am
od užívateľa gabberattack
marpes napísal:Je na tom nieco pravdy, ze posledne aplikacie vyzaduju 800 MB RAM/WU?


Zatial som nedostal updatnutu verziu Rosetty - akonahle zacne pocitat, dam vediet.

Napísané: Pi Dec 07, 2007 6:38 am
od užívateľa forest
marpes napísal:Je na tom nieco pravdy, ze posledne aplikacie vyzaduju 800 MB RAM/WU?

Šlo jen o pár jednotek, nemusíš mít strach. Není to o aplikaci, ale podle požadavků každé série WU.

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: St Jan 09, 2008 4:54 am
od užívateľa gabberattack
Bola uvolnena Rosetta verzia 5.93, ktora riesi "dihedralnu symetriu proteinov". Prelozene pre smrtelnikov: je vylepseny vypocet uhlov medzi dvoma rovinami v molekule - teda priestorovy uhol. Ako pisu na webe Rosetty, je to dolezite pre aplikaciu homooligomerov: bielkovin s rovnakou stavbou a casto aj strukturou, ktore sa odlisuju prave v priestorovom usporiadani atomov.

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: St Feb 06, 2008 7:25 pm
od užívateľa gabberattack
Bola uvolnena nova aplikacia - tkzv. "minirosetta". Sucasna aplikacia bola uplne prerobena tak, aby ulahcila buduci vyvoj. Jednotky budu postupne uvolnovane pre tuto novu aplikaciu, ktora zatial nema grafiku. Prechod na novu aplikaciu bol nutny z hladiska potiazi vyvoja novych protokolov, ktore boli stazovane uz velmi nafuknutym zdojovym kodom a s tym spojenymi problemami vychytavania chyb.

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: Št Mar 20, 2008 5:47 pm
od užívateľa gabberattack
Opat bola uvolnena nova aplikacia, tentoraz pre obe dostupne verzie softwaru - Rosetta 5.95 a miniRosetta 1.09. Su v nich opat zahrnute rozne updaty a upgrady.

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: St Okt 29, 2008 1:51 pm
od užívateľa Honza
Rosetta má novější miniRosettu a přidané nějaké features. Možná by stálo za to aktualizovat návod na GUI...?

The minirosetta application has been updated to version 1.39. In this version, we added two important applications to minirosetta, docking and protein folding with explicit zinc metal ion. New features have been added to the graphic to show chain colors for a multi-chain protein complex and display metal ions by sphere.

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: Pi Dec 05, 2008 6:20 am
od užívateľa Hefto99
Vcera bola uvolnena nova aplikacia, Minirosetta v1.45

V novej aplikacii by mali byt odstranene viacere problemy: napr. prilis dlhe casy spracovania tzv "relax uloh, problemy s validaciou, problemy s checkpointami, atd... mal by byt odstraneny aj problem s prepinanim medzi aplikaciami, kedy minirosetta veselo ficala dalej

Pripadne problemy a postrehy mozete reportovat v projektovom fore.

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: Ut Dec 16, 2008 3:58 am
od užívateľa Hefto99
Vcera bola uvolnena nova aplikacia Minirosetta v1.47

V aplikacii je opravenych viacero chyb (najvaznejsia chyba sposobujuca zrutenie vypoctu bola sposobena zle inicializovanou premennou).
Pripadne problemy mozete hlasit v diskusnom fore: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=4580#57902

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: Ut Jan 27, 2009 4:47 pm
od užívateľa Hefto99
Bola uvolnena nova aplikacia Minirosetta v1.54.
Nova aplikacia zahrna mnozstvo oprav roznych chyb, detaly najdete na fore:
Minirosetta v1.54 bug report thread

V pripade ak objavite akekolvek problemy, smelo ich reportujte v spominanom fore.

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: Št Feb 12, 2009 12:29 am
od užívateľa Kiwi
Padaju vam niektore Min. Rosetty 1.54 na x86_64 Lin. ?

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: Pi Mar 13, 2009 3:45 pm
od užívateľa gabberattack
Vsimol som si zaujimavu vec, Rosetta zacala posielat subory vo formate .zip, cim asi zacala reagovat na pretazenie pasma castym stahovanim jednotiek pouzivatelmi. Neviem ako dlho to takto funguje, akurat teraz mi to stiahlo zopar suborov, vsetky zazipovane. Chvalyhodna vec. :-)

Re: Aktualne aplikacie

Napísané: Pi Mar 13, 2009 4:43 pm
od užívateľa Kiwi
NO ja som mal 2 roky obmedzeny net na 2 GB, tak som cely tyzden nemohol nic pocitat,
lebo niektore projekty natahali 1 GB za par dni a do konca mesiaca ostavalo este 25 dni. :D
Rosetta je jeden z projektov, kde sa toho taha dost.