World Community Grid zakladne info

Diskusia k ostatným projekom a k projektom vo vývojovom resp. prípravnom štádiu

Moderátor: Moderátori

Užívateľov profilový obrázok
Kiwi
Príspevky: 2056
Dátum registrácie: Ut Feb 13, 2007 5:18 pm
Bydlisko: Sobrance
Kontaktovať užívateľa:

World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Kiwi » Ut Máj 08, 2007 4:34 pm

The United Devices Smallpox Research Grid Project bol sponzorovany IBM, aby sa
urychlilo liecenie virusu kiahni (smallpox). The Smallpox studia pouzila pocitacovu
chemiu v masivnom grid projekte na analyzu kandidatov na medicinske testovanie
proti virusu kiahni. Projekt pomohol zobrazit 35x10^6 moznych molekul lieciv
na niekolko proteinov virusu kiahni a zistit vhodnych kandidatov na liecbu.
Po 72 hodinach bolo vratenych 100 000 vysledkoch, do skoncenia projektu sa
objavilo 44 silnych kandidatov na dalsi vyskum. Po tomto uspechu IBM 16.11.2004
oznamilo vytvorenie World Community Grid (WCG), a vytvorilo prostredie, v ktorom mohli
bezat dalsie vedecke projekty. WCG najprv podporovalo len Windows pouzivajuc proprietarnu
technologiu z United Devices, ktora podporovala grid.org. Poziadavka na podporu Linuxu
viedla k open source BOINC grid technologii na ktorej bezi Seti@home and CPDN.
Bola zahrnuta aj podpora Mac OS. K 24.3.2007 mal WCG cca. 272 000 clenov a 550 000
pracovnych stanic. Strojovy cas je ekvivalentny 82 000 rokom a bolo ziskanych
80x10^6 vysledkov. WCG aktualizuje statistiku viac krat za den. Co je WCG ?
Je to projekt, z ktoreho profituju vsetci ludia, sponzorovany IBM. WCG spaja mnoho
pocitacov, vytvarajuc obrovsky system s velkym vypoctovym vykonom, ktory vysoko
prevysuje silu superpocitacov. Pretoze je praca rozdelovana na male kusky, ktore
je mozne pocitac sucasne, cas vypoctu je redukovany z rokov na mesiace.
Tato technologia je tiez velmi lacna, umoznujuc lepsie vyuzit drahe zdroje.

Completed Projects:

Human Proteome Folding Phase.

Prvym projektom bol
Human Proteome Folding Project 1 (HPF1), ktoreho cielom je predikovat strukturu
ludskych proteinov. Bol navrhnuty Richardom Bonneauom z Institute for Systems Biology,
na vypocet podobnych struktur pre kazdy protein a pouziva Rosetta skore.
Z tychto prognoz je mozne predpokladat funkciu nekonecneho mnozstva proteinov.
Tento narast poznatkov o ludskych proteinoch je velmi dolezity na hladanie
liecebnych metod ludskych nemoci. Tento projekt bol uzavrety 18.7.2006.

Aktivne projekty:

FightAIDS@Home
bol spusteny 15.11.2005, ako prvy projekt,
ktory bol cieleny iba na jedno ochorenie. Kazde PC pocita jednu moznu molekulu
lieku a zistuje ako sa naviaze na HIV proteazu, pracujuc ako jej inhibitor.
FightAIDS@Home pouzival do maja 2003, Entropia platformu.

Human Proteome Folding Phase 2 (HPF2)
bol ako treti projekt spusteny
23.6.2006. Tento projekt nasledujuc HPF1, je zamerany na sekrecne proteiny,
zo specialnym zameranim na biomarkery a proteiny na povrchu buniek, ako
aj na plasmodium, povodcu malarie. HPF2 pouziva modely proteinov s vyssim
rozlisenim, ktore maju lepsiu vyuzitelnost, ale tiez potrebuju vykonnejsie PC.
To bol vylucne prvy projekt WCG, ktory nebol zdielany s inymi grid projektmi.
WCG bude v buducnosti spustat exkluzivne svoje projekty.

Help Defeat Cancer
bol spusteny 20.7.2006. Bol zamerany na zlepsenie liecby
rakoviny prsnika, mozgu a krku. Velke mnozstvo tkaniv bolo preskumanych
technologiou, ktora skuma vzorky tkaniva priemeru 0.6 mm, ulozenych
po odbere do parafinu, v poli max. 32x32 vzoriek. Tie su potom skenovane.

Genome Comparison
bol spusteny 21.11.2006, z Fiocruz v Rio de Janeiro.
Porovnava genove sekvencie medzi roznymi organizmami, za ucelom najdenia
podobnych genov. Cielom je objavenie toho, naco sluzi prislusna sekvencia
a aku funkciu plni v jednom organizme a jej porovnanie so znamou funkciou
v inom.

Help Cure Muscular Dystrophy
je najnovsim projektom a bol uvolneny
19.12.2006 Decryphton, ( spolupraca French Muscular Dystrophy Association,
French National Center for Scientific Research a IBM ). Projekt zistuje
vzajomne reakcie proteinov, medzi 40 000 proteinmi, ktorych strukturu
pozname, so zameranim na tie, ktore hraju rolu v nervovo-svalovych ochoreniach.
Produkovana databaza pomoze vedcom vyvinut molekuly, na inhibiciu alebo
zvacsenu vazobnu schopnost niektorych makromolekul, veducich k lepsej
liecbe svalovej dystrofie a inych nervovo-svalovych ochoreni.

To je asi vsetko, spustite na necinnych pocitacoch, ktore spotrebuvaju
120 W vykonu na 0.1 promile cinnosti procesora, nieco uzitocne, vykon
sa zvacsi asi o 15 az 65 W, ale prinesie to uzitok chorym a vam radost,
ze ste niekomu pomohli, vyrazne zlepsit kvalitu zivota. :)
Podstata objavu spočíva vo videní niečoho, čo videli všetci a v premýšľaní o niečom, na čo nikto nepomyslel.
Tachyum Rado Danilák Rottenkiwi

Užívateľov profilový obrázok
slavko.sk
Príspevky: 1603
Dátum registrácie: Po Feb 05, 2007 4:42 pm
Bydlisko: Bratislava, Slovensko
Kontaktovať užívateľa:

Príspevokod užívateľa slavko.sk » Ut Máj 08, 2007 4:58 pm

Ahoj, z toho by bolo urobit clanok na hlavnu stranku, co ty na to?

Užívateľov profilový obrázok
matob
Príspevky: 932
Dátum registrácie: Pi Dec 14, 2007 12:16 am
Bydlisko: Dudince & Banská Bystrica
Kontaktovať užívateľa:

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa matob » Ut Nov 04, 2008 12:26 am

Obrázok

Užívateľov profilový obrázok
Kiwi
Príspevky: 2056
Dátum registrácie: Ut Feb 13, 2007 5:18 pm
Bydlisko: Sobrance
Kontaktovať užívateľa:

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Kiwi » Ut Nov 04, 2008 1:37 am

Poslal si tam video ?
Podstata objavu spočíva vo videní niečoho, čo videli všetci a v premýšľaní o niečom, na čo nikto nepomyslel.
Tachyum Rado Danilák Rottenkiwi

Užívateľov profilový obrázok
matob
Príspevky: 932
Dátum registrácie: Pi Dec 14, 2007 12:16 am
Bydlisko: Dudince & Banská Bystrica
Kontaktovať užívateľa:

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa matob » Ut Nov 04, 2008 10:04 am

Nie nie.. toto jedno tam uz bolo..
Myslim, ze je celkom vydarene
Obrázok

Užívateľov profilový obrázok
numlock
Príspevky: 113
Dátum registrácie: So Júl 05, 2008 11:06 pm

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa numlock » Ut Feb 24, 2009 10:13 pm

Prihlásil som sa WCG, vypocitalo pár jednotiek a neskor mi vytuhol cely BM. Nepomol ani restart. Poriesil to az reinstal BM. Jednotky skoncili s "compute errorom". Momentalne mam nastavene "neprijimat nove ulohy".
Kde je chyba?
Obrázok Q6600 @ 3600MHz , 4GB Ram , HD5850 , win7 x64

Užívateľov profilový obrázok
Palo M.
Príspevky: 1190
Dátum registrácie: Po Feb 12, 2007 3:53 am
Bydlisko: Shanghai, China

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Palo M. » St Feb 25, 2009 5:40 am

Z toho velmi mudry nie som. WCG ma niekolko podprojektov, kazdy ma inu aplikaciu. A vacsina z nich je zrava na pamat. Na dvojjadre s 512M mi to robilo problemy (sice to nepadalo, ale niekedy to zacalo swapovat ako sproste a chvilu to vobec nic nerobilo a dokola swapovalo) - ale to je aj dosledok toho, ze Windoze (XXXMega hned po starte) + M$ Outlook (>100M) + prisiel mail (+150M VsTskMgr z firemneho rezidentneho McAfee scannera)... ked masina bezala v noci, ked bol Outlook vypnuty, nerobilo to blbosti.
Takisto, niektorym aplikaciam trva dost dlho, kym sa dopocitaju po prvy checkpoint. Takze ked ti medzitym prepne manager na iny projekt, aj tak ti zostane 250M z WCG v pamati, co nepotesi.

Tak pozri, ake aplikacie/projekty ti vlastne bezali. A kolko mas pamate.
Takisto neviem, ci si nemal masinu pretaktovanu, mozno je WCG citlivejsie na nestabilitu...

Užívateľov profilový obrázok
numlock
Príspevky: 113
Dátum registrácie: So Júl 05, 2008 11:06 pm

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa numlock » St Feb 25, 2009 10:05 am

Mam nastavene pocitat vsetky podprojekty. V statistike vidim 3 typy roznych uloh so statom "error" (dokopy 5 uloh). Pamete mam 4GB, a aj pocas vytuhnutia to bohate stacilo (bez nejakeho velkeho swapu). PC je pretaktovany, ale stabilny.
Naozaj neviem... neskor tam skusim znova pustit pár WUčiek.
Obrázok Q6600 @ 3600MHz , 4GB Ram , HD5850 , win7 x64

Užívateľov profilový obrázok
Palo M.
Príspevky: 1190
Dátum registrácie: Po Feb 12, 2007 3:53 am
Bydlisko: Shanghai, China

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Palo M. » St Feb 25, 2009 11:38 am

Pretaktovany ale stabilny? Hmmm... Podla Eagla stabilne PC neexistuje a kazdy stroj po istom (dostatocne dlhom) case zhuci na nestabilitu... Samozrejme, ak stroj bezi kratsie, ako je ta priemerna doba zlyhania, tak sa to neprejavi... Lenze ked clovek rata BOINC a masina bezi 24/7...
Ak to je ten stroj, co mas v podpise (Q6600@3600MHz, 64-bitovy system), tak by som ako prve pochyboval o tej stabilite. Predsa len, pretaktovat o 50% je dost (a 64-bitovy beh je dalsi faktor, aspon A64ky boli take, ze ten isty procak mal inu hranicu v 32-bit ako v 64-bit)...

Užívateľov profilový obrázok
Kiwi
Príspevky: 2056
Dátum registrácie: Ut Feb 13, 2007 5:18 pm
Bydlisko: Sobrance
Kontaktovať užívateľa:

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Kiwi » St Feb 25, 2009 4:22 pm

Kazdy projekt inak zatazuje RAM a CPU. Napr. na Milky a ABC stacia nizsie napatia a je to stabilne,
ale na ine napr. PrimeGrid, treba pridat, dokedy sa nestabilizuje teplota okolia resp. teplota vody v okruhu,
a dojde k tepelnej rovnovahe medzi prijmom a vydajom tepla. Ja napr. chladim vodou, cca. 8 *C, takze
ked pocitam milky ci abc, tak ma CPU 11 *C a jadra o 10 viac, ale ked tam dam ine projekty, po par
dnoch ma 250 l vody v chladici, uz 15 * C, pricom to je v sklade, kde je 2 az 5 *C air, a do PC vedu
6 m hadice. Ked ti nepadne PrimeGrid, nepadne ti ani rosetta, WCG ci magnetism.
Podstata objavu spočíva vo videní niečoho, čo videli všetci a v premýšľaní o niečom, na čo nikto nepomyslel.
Tachyum Rado Danilák Rottenkiwi

Užívateľov profilový obrázok
Kiwi
Príspevky: 2056
Dátum registrácie: Ut Feb 13, 2007 5:18 pm
Bydlisko: Sobrance
Kontaktovať užívateľa:

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Kiwi » St Máj 06, 2009 12:04 am

World Community Grid has started a new research project that will use your donated computer time to find new drugs that can stop the spread of an influenza infection in an individual. The research will specifically address the influenza strains that have become drug resistant, as well as new strains that are appearing. Your computer will help identify the chemical compounds that are the best candidates. This will accelerate the efforts to develop treatments that would be useful in managing seasonal influenza outbreaks and future influenza epidemics.

Takze mozeme pocitat lieky na Novu chripku. :)
Podstata objavu spočíva vo videní niečoho, čo videli všetci a v premýšľaní o niečom, na čo nikto nepomyslel.
Tachyum Rado Danilák Rottenkiwi

Užívateľov profilový obrázok
Hefto99
Príspevky: 750
Dátum registrácie: Ut Feb 06, 2007 12:59 am
Bydlisko: Zürich, Schweiz

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Hefto99 » St Máj 06, 2009 2:20 am

Kiwi,

co tak dat novinku aj na stranku boinc.jadro.org?
Alebo uz ju nebudeme dalej rozvijat, kazdemu staci/vyhovuje terajsi stav?
Keď nevieš kde si, nemôžeš zablúdiť.
Obrázok

Užívateľov profilový obrázok
Kiwi
Príspevky: 2056
Dátum registrácie: Ut Feb 13, 2007 5:18 pm
Bydlisko: Sobrance
Kontaktovať užívateľa:

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Kiwi » St Máj 06, 2009 3:08 am

No ja som dead, oci o -1 D, takze na jedno oko nemozem zaostrit, taky mam astigmatizmus,
a 7 dni rezem drevo, mam 6 kil dole a este ho treba rubat. Ked nemam drevo mam stres
a stres rozostruje aj to druhe oko, takze najprv musim poriesit drevo, potom lieky na oci
a potom skusim nieco napisat. Od septembra som nenapisal nic ani tu ani na jadro
ani na wiki. Zail oftalmologicka nevie, preco sa to zhorsuje, pravdepodobne v dosledku
interakcie mojich liekov na epilepsiu a schizofreniu s inymi liecivami, resp. je to side
effect tych liekov, su to lieky ktore sa pouzivaju 40 a 20 rokov, takze uz su novsie,
ale tie kazdy na SVK nedostane. Vsimol som si, ze na GPUGRIDE sa pocita nieco,
co ma suvis s mojimi liekmi, zial zatial nemam vhodnu GPU, tak sa nemozem zapojit.
Este nemam ani paradajky posadene, po ine roky my uz v takom case kvitli.
Vyse mesiaca neprsalo, kazdy vecer 500 l, vypolievat rucne tiez sposobuje fyzicky
stres, proste nie som vrcholovy sportovec, aby som to vsetko zvladal.
Podstata objavu spočíva vo videní niečoho, čo videli všetci a v premýšľaní o niečom, na čo nikto nepomyslel.
Tachyum Rado Danilák Rottenkiwi

Užívateľov profilový obrázok
Duro Kotulic Bunta
Príspevky: 1862
Dátum registrácie: St Feb 07, 2007 4:00 pm
Bydlisko: Stupava
Kontaktovať užívateľa:

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Duro Kotulic Bunta » St Máj 06, 2009 8:00 am

Kiwi, to drevo spominas casto - existuju stiepacky dreva, napr. len teraz som namatkovo nasiel jednu hydraulicku http://stroje.bazos.sk/inzerat/1645166/ ... -DREVA.php

Je to cena dvoch novych procikov, ked pozeram na tvoj RAC tak pravdepodobne stiepacka nebude vacsia diera do rozpoctu ako computing HW ktory mas..
tot len taka idea v reakcii na to co casto pises, aj ked pochybujem ze si o niecom takom este neuvazoval..
It is by logic that we prove, but by intuition that we discover. [J.H. Poincaré, mathematician]
A man who knows how to be alone is never lonely. [Osho]

Užívateľov profilový obrázok
Kiwi
Príspevky: 2056
Dátum registrácie: Ut Feb 13, 2007 5:18 pm
Bydlisko: Sobrance
Kontaktovať užívateľa:

Re: World Community Grid zakladne info

Príspevokod užívateľa Kiwi » St Máj 06, 2009 1:00 pm

Hej teraz som poriesil motorovu pilu, lebo inak by som musel aj ten posleny PC vypnut,
a stiepacky s takou silou aku mam ja su cez 30 000, takze som to poriesil 3 kg sekerou
za 20 €. :) Akurat ta sekera a pila maju spotrebu 7 kg mojho tela / 5 dni prace / 3 hod. denne,
a potom musim mesiac zrat za 8000, aby som tych 7 kg pribral. :)
Podstata objavu spočíva vo videní niečoho, čo videli všetci a v premýšľaní o niečom, na čo nikto nepomyslel.
Tachyum Rado Danilák Rottenkiwi


Návrat na "Ostatné projekty"

Kto je prítomný

Užívatelia prezerajúci toto fórum: Žiadny pripojení užívatelia a 11 neregistrovaných